OpenAI的GPT-Rosalind:更强的生命科学模型和更全面的工作台
OpenAI的GPT-Rosalind:
更强的生命科学模型和更全面的工作台
作者:贝叔 | 且来山笔记
2026年6月9日,Anthropic发布史上最强大模型Claude Fable 5,而仅仅过了3天就被美国政府依据出口管制法规下达管制令而全球禁用。在这个戏剧化的过程背后,Fable 5在生物学问题上展现的自主长流程解决问题能力,以及在候选药物设计、AAV设计的优异表现,让大模型能不能取代生物学家,再次成为行业最热烈的讨论。—— 在发布的时候,Anthropic出于对安全的考虑,限制了模型对生物学问题的处理。
而仅仅在一周之前——2026年6月3日——OpenAI发布了GPT-Rosalind的首次重大更新,致力于打造一个围绕生命科学的专用模型、集成工作流和专用工具的专业工作台。领先的通用大模型,必然会涌向生命科学这个垂直领域,并直面这个领域固有的挑战,解决物理世界的重大问题。
如果说Anthropic让一个超强的通用模型在生命科学研究能力上秀了一次肌肉,而OpenAI走的是另一条路:专门为生命科学训练一个模型。 承载这一使命的GPT-Rosalind,目标也远不是一个会生物学的聊天机器人,而是要成为一个能干活的超级员工。
一、GPT-Rosalind 是什么
一句话总结:GPT-Rosalind的本质,是一个作为集成者与协作伙伴、通过融合分散的科学数据与实验工具来加速药物研发从假设生成到验证全流程的智能引擎。
OpenAI以DNA双螺旋结构的关键贡献者Rosalind Franklin来命名这个模型。Rosalind Franklin的严谨实验研究帮助揭示了DNA的双螺旋结构,为现代分子生物学奠定了基础,但可惜的是她没有出现在诺贝尔奖的获奖名单中。传说在睡梦中梦到两条缠绕的蛇的Crick,与Watson共同完成了DNA双螺旋结构的论文,分享了1962年的诺贝尔奖。
2026年4月16日 — GPT-Rosalind首次发布(研究预览版)
首版GPT-Rosalind的核心能力即完整体现了其本质,通过Life Science Research Plugin集成生命科学研究所需的科学数据和实验工具,实现自主实验设计与结果分析;但是ChatGPT通过可信访问计划限制了这个超级员工的使用。
GPT-Rosalind的核心能力覆盖五个领域:
- 有机化学反应机制推理
- 蛋白质结构与突变效应理解
- DNA序列的系统发育解释
- 实验设计与结果分析
- 计算工具与数据库的正确选择与使用
为了让大模型正确选择和使用计算工具与数据库,在Codex平台上开源了Life Sciences Research Plugin。
- 这是一个编排层(orchestration layer)
- 包含超过50个模块化科研技能,覆盖人类遗传学、功能基因组学、蛋白质结构、生物化学、临床证据和公共研究发现六大领域
- 它能让模型接入50多个公共多组学数据库、文献来源和生物学工具;结合Codex的Agent设计,将宽泛、模糊、多步骤的研究问题拆解为可执行的工作流
OpenAI通过可信访问计划(Trusted Access),将GPT-Rosalind变成了事实上的准入受限系统;可信访问计划的原则是”有益使用、强治理与安全监督、受控访问与企业级安全”,要求申请机构通过资格认证和安全审核。
首版发布时即宣布了与13家机构的合作:
- Amgen(安进)、Novo Nordisk(诺和诺德)、Moderna、Dyno Therapeutics
- Thermo Fisher Scientific、NVIDIA、Oracle Health
- Allen Institute、UCSF药学院、Benchling、洛斯阿拉莫斯国家实验室
- 以及McKinsey、BCG和Bain三家咨询公司
特别值得关注的是Dyno Therapeutics的合作成果。Dyno使用未发表、未受污染的真实RNA序列数据评估了GPT-Rosalind。在RNA序列到功能的预测任务中,GPT-Rosalind的排名超过了AI生物领域人类专家的第95百分位;在序列生成任务中,约为第84百分位。这不是一个合成基准测试中的分数——它是在真实、未发表的数据上,对标真实人类专家的表现。
在标准基准测试方面:BixBench(真实世界生物信息学和数据分析)上GPT-Rosalind取得领先表现;LABBench2(涵盖文献检索、数据库访问、序列操作和协议设计)的11项任务中,6项优于GPT-5.4,其中最显著的改进来自CloningQA——要求端到端设计分子克隆方案的DNA和酶试剂。
2026年5月29日 — Rosalind Biodefense 计划启动
在主更新前几天,OpenAI启动了Rosalind Biodefense计划,将GPT-Rosalind的应用范围从商业药物发现延伸至生物防御领域,为GPT-Rosalind进入政府级研究机构和国家合同铺平了合规之路。
2026年6月3日 — 首次重大更新
6月更新是GPT-Rosalind从”研究预览”走向”可部署产品”的转折点,一方面增强自主执行科学计算任务的能力,另一方面通过LifeSciBench基准测试系统设置系统演进的路线图。
- 集成GPT-5.5的智能体编码与工具调用能力。 在一个集成的工作环境中,就可以完成所有的任务;但更关键的是GPT-Rosalind被赋予了一种新的行为模式——它不仅能推理,还能主动规划和执行科学计算任务。OpenAI的表述是”from reasoning to executed workflows”(从推理到执行工作流),更通俗的理解是从Doer变成Planner and Doer。
- 发布LifeSciBench基准测试体系。 这是一个由外部专家评审的评估框架,跨越六大核心工作流:证据处理、分析、设计与优化、科学推理、验证与运营、转化与沟通。值得注意的是,这个评测体系不仅对模型的输出结果进行评测,也对其中每个主要步骤的每个环节单独进行评测;对能力的数量化评价,为后续演进提供了冷酷而客观的指引。
- 从”仅限美国”扩展到”全球合规研究机构”。 访问范围扩大,无现有Enterprise协议的组织可通过新设立的OpenAI托管工作空间申请使用。
- 公开所有自建基准的测评结果。四个自建基准全部上线:
| 基准名称 | GPT-Rosalind | GPT-5.5 | 说明 |
|---|---|---|---|
| LifeSciBench | 领先 | — | 六维度端到端工作流 |
| MedChemBench | 27.5% | 25.1% | 药物化学 |
| GeneBench | 21.6% | 20.4% | 基因组学与定量生物学 |
| LabWorkBench | 63.2% | 55.8% | 湿实验室方案辅助 |
注:以上为OpenAI自报数据,独立第三方验证尚未完成。
二、生命科学的数据和推理问题
Amgen是GPT-Rosalind首发时就合作的机构,担任AI与数据高级副总裁的Sean Bruich的表态:”生命科学领域要求每一步都精确。问题极其复杂,数据极其独特,风险极高。我们与OpenAI的独特合作使我们能够以新的、创新的方式应用其最先进的能力和工具,有可能加速我们向患者提供药物的速度。”
在极高的决策风险下,Rosalind怎么克服独特数据的挑战,解决极其复杂的问题,是她最终能否进入药企决策流程的基础。
第一个硬问题:数据
化学结构和蛋白质序列不是同一类数据。基因组学和临床证据也不是。每一类数据都有自己独立的数据库、格式和访问协议。
一个最简单的靶点发现任务,可能同时需要查询化学数据库、蛋白质结构库、文献和临床试验——这意味着一个科学家的一天,有一半耗在了在不同平台之间切换。
通用大语言模型是使用大的小数据训练,而生物学数据是小的大数据。
格式不统一、碎片化、规模小,是生命科学研究数据的“极其独特”的特点,也是”更大的模型 + 更多的训练数据”在这个领域不够用的原因。
GPT-Rosalind的解法有两层,一是针对50种最常见的生物学工作流的训练,二是在模型外面架了一层编排系统——Life Sciences Research Plugin。先理解研究问题,然后规范化实体(基因、蛋白质、疾病、变体),最后路由到正确的数据库完成正确的查询。50多个公共多组学数据库被纳入同一个入口,研究流程从”在不同平台之间跳转”变成了”在一个界面上完成”。
第二个硬问题:推理
生命系统是极其复杂的系统。生命活动从分子、细胞、组织、器官到个体,跨越不同层次,紧密耦合互相影响;系统整体行为不等于各部分行为的简单加总,大规模非线性相互作用涌现出全新特性。
对生命系统的认知和理解极其复杂。生命科学研究产生的极其复杂的数据,如何识别真正的生物学信号,极其挑战;而依赖拆解研究的归纳还原,面对复杂系统,往往只见树木;对一个问题的求解,往往需要在多个目标上优化平衡。
现代生命科学研究逐渐进化成多步骤逻辑推演的复杂科学工作流,是从假设生成到证据收集、实验设计、结果解读的闭环迭代;每一步都是开放性的,结果必须可复现、可追溯、可解释。
Rosalind在设计之初,其结构就被定义为能够规划和执行一系列逻辑步骤以解决复杂问题。在训练时,使用生物专有数据进行训练,重点关注结构化的科学世界和实验结果之间的关系,从机制正确性、结构一致性、试验成功概率、低风险预测等多目标进行优化,结合专家反馈以及直接用实验结果反馈进行强化学习。
贝叔的理解是,GPT-Rosalind学习了很好的分解问题并自动执行的能力。
三、贝叔的思考
对行业有什么影响?成为生命科学研究工作台的理想飞扬,现实的模型评测分数还差强人意;全流程的工作能力意味着客户适用时影响分析范围的扩大。在成为药企工作台的道路上,AI制药的伙伴们还有时间去尝试。
Rosalind能提出有价值的问题了吗?
🔍 案例:FDA Type B 沟通准备
贝叔被OpenAI公布的一个FDA沟通案例吸引(见OpenAI官方博客2026.06.03更新)。这是为AAV9-microdystrophin 基因疗法的Type B FDA meeting做准备,Rosalind对材料包提出很多问题,如MANEX1A 抗体表位共享、Western blot 标准品错位、IF 用 C-terminal 抗体但构建体本身缺 C-terminal、NSAA 用 external natural-history cohort 做对照、4-7 岁年龄窗发育性混杂、AAV 持久性、转氨酶升高、心肌炎、anti-AAV9 排除标准的 generalizability 缺口等等,切中监管要害。
这个案例完全符合OpenAI对推理的定义:”规划和执行一系列逻辑以解决复杂问题”,但复杂问题,还是由碳基生物来定义。
从创造独特价值的角度,一个复杂问题的提出,才是后续一切的源头。也许更强的模型叠加更好的智能体,硅基生物正在无限逼近提出这种好的复杂问题的能力。
参考信源:OpenAI官方博客(2026.04.16 / 2026.06.03)、Anthropic官方公告(2026.06.09 / 2026.06.12)、腾讯新闻 / 搜狐科技中文转述、BioTender Issue 06分析